Rinnegan
Rinnegan (jap. 輪廻眼, Rinnegan? dosłownie "oko Samsary") jest najpotężniejszym z trzech wielkich ocznych technik (jap. 瞳術, ? – dōjutsu). Rinnegan charakteryzuje się jaśniejącymi szarymi obwódkami wokół źrenicy użytkownika. Oczy te umożliwiają wędrówkę duszy między innymi ciałami, jako niekończący się cykl narodzin, śmierci i odrodzenia. Powiedziane jest też, że jego moc jest wystarczalna do uratowania bądź zniszczenia świata, chociaż nie podano jakie rodzaje technik pociąga za sobą. Po raz pierwszy został opanowany przez Mędrca Sześciu Ścieżek (jap. 六道仙人, ? – Rikudō Sennin), założyciela całego świata ninja. Pierwsze ninjutsu pochodziły z jego zdolności. Pein, obecny i jedyny znany użytkownik tej zdolności, aktywował ją w trakcie swego dzieciństwa, by uratować jednego ze swych przyjaciół (Yahiko).
- Posiadacze Rinnegana
Byakugan
Posiadaczami Byakugan'u (jap. 白眼, Byakugan'u? dosłownie "białe oczy") są członkowie klanu Hyūga. Podobnie jak Sharingan (który zresztą wywodzi się z Byakugana), jest zlokalizowany w tęczówce posiadacza i jest aktywowany poprzez użycie pewnej ilości chakary, bez potrzeby wykonywania pieczęci. Kiedy Byakugan jest aktywny w okolicach oczu użytkownika, pojawiają się żyły, podobno są to powiększone kanaliki chakry, lecz ta informacja nie została potwierdzona, a w naturalnie białych oczach pojawia się lekka obwódka źrenicy. Byakugan pozwala shinobi, na widzenie przez prawie wszystko oraz odczytywać myśli przeciwnika z ruchu jego oczu. Daje także shinobi pole widzenia 359 stopni dzięki czemu może dostrzec każdy atak z odległości 50 metrów, użytkownik widzi też wszystko w zwolnionym tempie. Najlepszą umiejętność jaką daje to kekkei genkai, jest umiejętność widzenia wewnętrznego Centrum chakry (czyli wewnętrznego źródła chakry) przeciwnika oraz możliwość dokładnego zaatakowania danego centrum. Można także trafiać w Tenketsu przeciwnika (punkty na ciele, wielkości główki szpilki, przez które "wypływa" chakra), co pozwala na zatrzymanie przepływu chakry i zadania ostatecznej klęski przeciwnikowi. Byakugan podobnie jak Sharingan, sromotnie przegrywa z szybkością, nawet jeśli użytkownik widzi atak, to nie jest w stanie zareagować na czas. Jest także w jednym punkcie - koło potylicy - ślepy i nie widzi nadchodzących z tej strony ataków. Jest to o tyle istotne ze, osoba trafiona w ten punkt ginie od razu.
- Posiadacze Byakugana
Sharingan
Sharingan (jap. 写輪眼, Sharingan? dosłownie "kopiujące oko ") wywodzi się z innej linii krwi Byakugana i jego posiadaczami są członkowie (prawie całkowicie wymarłego) klanu Uchiha. Jest to specjalna zdolność zlokalizowana w oku (źrenicy) shinobi, który aktywuje go poprzez użycie pewnej ilości chakry, bez potrzeby wykonywania pieczęci. Aby Sharingan był skuteczny, należy go łączyć z innymi nin, tai i gen-jutsu, więc posiadacz musi prezentować wysoki poziom jeśli chodzi o jego wartość bojową. Sharingan daje posiadaczowi parę przydatnych umiejętności. Są nimi np: zwiększenie szybkości reagowania, gdy przeciwnik bardzo szybko się porusza, czy też umiejętność rozróżnienia wroga wśród stworzonych przez niego klonów Jutsu lub iluzji. Dzięki iluzji, użytkownik Sharingana może także wprowadzić swojego przeciwnika w stan, w którym wydawać mu się będzie, że Sharingan widzi przyszłość i czyta w myślach, co bardzo mu utrudni dalszą walkę. Najbardziej unikatową zdolnością Sharingana, jest możliwość skopiowania ruchów przeciwnika, a co za tym idzie, każdej widzianej przez niego techniki czy to Nin, Gen albo Tai jutsu, nawet jeżeli widziano ją tylko raz. Dzięki temu ninja, może posiadać niezliczoną liczbę technik w swoim arsenale, bez potrzeby ich trenowania, co czyni z nich naprawdę niebezpiecznych przeciwników. Technika ma swoje wady. Sharingan jest bezużyteczny przeciwko szybkości, na których opiera się większość technik Taijutsu. Jeśli nawet Sharingan potrafi przejrzeć daną technikę, brakuje mu już czasu na reakcję, przez co staje się podatny na ataki. W dodatku użytkownicy Taijutsu prawie w ogóle nie używają chakry (jest "marnowana" na stałe rozwijanie swej szybkości, siły i wytrzymałości) i walczą głównie z użyciem pięści. Sharingan jest także bezużyteczny przeciw innym posiadaczom kekkei genkai, gdyż nie potrafi skopiować stosowanych przez nich technik.
